分享 Vim 与 nvim-R的整合的开发环境(支持 knit 和 rmarkdown,python混编) ... ... ... ...
阿平 2017-11-20 07:37
最后的还是用vim了,R的开发用Rstudio其实挺好用的,但是本地用用还好,在cluster或超算中心用肯定不方便了。 现在记录一下我配置nvim-R插件为中心的主要配置方法(Mac OS环境):1 1. 安装 pandoc brew install pandoc 2. 安装 LaTex (MacTex,基本版就差不多,完整版实在太大了) 到 http://www.tug.org/mactex/more ...
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分享 Vim/NeoVim支持Python的解决
阿平 2017-11-19 08:20
在Mac OSX下用homebrew 安装neovim的一个副作用是天然不支持python,使得neovim整合python的环境无法正常工作。 一个解决办法是不用homebrew的neovim而重新编译neovim并加入 “--enable-pythoninterp”。 不过我发现还有另一个解决办法,就是直接 “pip install neovim"就可与你解决问题,并继续使用homebrew的neovim。 ...
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分享 Python Pandas 知识点小抄 Cheat Sheet
阿平 2016-12-24 07:53
学Pandas也有不少东西要记住,小抄在手 ,数据无忧特此与大家共享! 下载附件
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分享 wxPython 3零碎笔记
阿平 2015-5-22 05:21
从wx3.0以后: 1. wx.InitAllImageHandlers() 直接被取缔了,简单粗暴将该语句去掉就行。 2. setlocale()的写法被self.locale = wx.Locale(wx.LANGUAGE_ENGLISH)取代,防止与系统本地冲突 3. wx.PySimpleApp 被 wx.App替代 4. 事件处理方式可能有所改变,需要仔细测试才知 5. MakeModal被取缔 ...
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分享 用PyMOL查看蛋白质表面静电势(Electrostatic potential)
阿平 2015-2-9 01:05
用PyMOL查看蛋白质表面静电势(Electrostatic potential)
(windows系统下为例) 第一步:安装APBS PyMOL (1.7) 好像本身就有支持的插件,但是APBS的主程序还是要安装一下的。 http://sourceforge.net/projects/apbs/ 下面找到最新的APBS安装包,比如我用的是APBS 1.4.1。 解压后将apbs文件夹放到C:盘根目录(这个自己可随意) 第二步:将pdb文件生成pqr文件 到下面网站 http ...
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分享 系统生物学中的重要数字
阿平 2015-1-26 16:38
细胞体积多大,细胞核多大,胞内蛋白的浓度多少? 这些问题其实是在一些具体的生物问题中还是要被常常问到的。 BioNumber 这个网站网罗了不少这样的数据,要用时可以参考一。 链接:http://bionumbers.hms.harvard.edu 还有换算数据我感觉也是有用的,比如: 1 立方微米 = 10的-15次方升, 1 道尔顿 = 1.66053 * 10的-24次 ...
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分享 科学网在copy新科学网吗?
francis_小鱼 2014-8-27 21:08
打开新科学网的个人空间时,发现界面和科学网,惊人的相似。不知是科学网在copy新科学网,还是新科学网在copy科学网呢?还是新科学网的核心成员被科学网挖去了呢?
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