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有读书笔记有附件Regulation of Alternative Splicing by Histone Modifications

热4 yonghao616 添加于 2010-6-9 15:32 | 1846 次阅读 | 1 个评论

  •  作 者

    Luco RF, Pan Q, Tominaga K, Blencowe BJ, Pereira-Smith OM, Misteli T

  •  摘 要

    Alternative splicing of pre-mRNA is a prominent mechanism to generate protein diversity, yet its regulation is poorly understood. We demonstrated a direct role for histone modifications in alternative splicing. We found distinctive histone modification signatures that correlate with the splicing outcome in a set of human genes, and modulation of histone modifications causes splice site switching. Histone marks affect splicing outcome by influencing the recruitment of splicing regulators via a chromatin-binding protein. These results outline an adaptor system for the reading of histone marks by the pre-mRNA splicing machinery.

  •  详细资料

    • 关键词: BINDING; EXON; TRANSCRIPTION; RECOGNITION; ELONGATION; CODE; IIIB; PTB; H3
    • 文献种类:期刊
    • 期刊名称: SCIENCE
    • 期卷页: 2010年  第327卷 第5968期 996-1000页
    • 出版社: AMER ASSOC ADVANCEMENT SCIENCE, 1200 NEW YORK AVE, NW, WASHINGTON, DC 20005 USA
    • 地址: 1. NCI, NIH, Bethesda, MD 20892 USA 2. Univ Toronto, Banting & Best Dept Med Res, Terrence Donnelly Ctr Cellular & Biomol Res, Toronto, ON M5S 3E1 Canada 3. Univ Texas Hlth Sci Ctr San Antonio, Barshop Inst Longev & Aging Studies, Dept Cellular & Struct Biol, San Antonio, TX 78245 USA
    • ISBN: 0036-8075

  • 相关链接 DOI  

  •  附 件

    PDF附件Regulation of Alternative Splicing by Histone Modifications 

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    组蛋白修饰对可变剪接的调控

    可变剪接是影响蛋白产物的一种重要机制，这种机制的损坏可能导致很多疾病。之前的研究已经表明，可变剪接位点的选择受到了RNA聚合酶Ⅱ延伸速度、染色质重塑物以及组蛋白乙酰化酶抑制剂的影响，并且基因组水平的研究表明在外显子区域核小体和一些组蛋白修饰标记都不是随机分布的。鉴于以上的现象，作者猜测组蛋白修饰对可变剪接有调节作用。

    通过染色质免疫沉淀对纤维母细胞生长因子受体2（FGFR2）基因上的几种组蛋白修饰标记的分析，发现不同的剪接类型之间有组蛋白修饰标记的不同（如H3K36me3）。接着作者通过高表达或者下调特定组蛋白修饰酶的活性（如产生H3K36me3的SET2），导致组蛋白标记水平的改变，发现响应的可变剪接水平也发生了改变。然后作者探讨了这种组蛋白修饰影响可变剪接的分子机制。作者发现是一个染色质结合蛋白MRG15在中间起着调节子的作用。依据以上实验结果，提出了一种衔接头模型。

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