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【Plos Genetics】人类基因组多样性研究计划(HGDP)新p ...
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【Plos Genetics】人类基因组多样性研究计划(HGDP)新paper
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drjiangbo
drjiangbo
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发表于 2011-1-12 18:17:05
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本帖最后由 drjiangbo 于 2011-1-12 18:18 编辑
人类基因组多样性研究计划(HGDP)基于单核苷酸多态性(SNPs)的全基因组关联人群研究:非连锁SNPs的选择是否影
响共享性状的关联分析?
【导读】(自己翻译,水平不好,请感兴趣的同学下PDF啦~)
journal.pgen.1001266.pdf
(460.45 KB, 下载次数: 925)
2011-1-12 18:16 上传
点击文件名下载附件
全基因组关联研究(GWAS)已经确认了2000多个性状相关SNP的关联性,而且此数目不断增加。 GWAS主要对人类健康可能造成的后果性状,包括许多免疫学,代谢,心血管,和行为表型进行研究。鉴于复杂性状多基因的性质,选择可能通过在许多相关位点改变等位基因频率发挥影响,此经验性的方法本身还有待探索。
此研究中,利用38种评价等位基因频率变化的方法和8iHS分值来评价在全球53分布个人种的超过1300个GWAS的SNPs特征。运用同样的技术通过性状-关联分析来评估不同分组的SNPs。
结果发现,在某些地区与色素沉着,高血压,传染性疾病及自身免疫性疾病组性状关联的SNPs表现出不正常的等位基因频率,HIS分数升高。欧亚大陆和东亚地区GWAS的SNPs等位基因频率变化和his分值都偏高。
此研究的结果对一些在关联位点等位基因频率改变和/或高his分值的复杂性状进行研究选择提供依据。
研究结果还表明,可能由于不同连锁不平衡方式的存在,在欧亚人群观察到的性状-SNPs关联分析可能不表现于非洲、大洋洲和美洲。可能是由于连锁不平衡模式的差异。这一观察 表明非欧亚和非东亚人群样本应包括在今后的GWAS内。
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阿平
Dr.LinZhen
北木
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阿平
阿平
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发表于 2011-1-16 06:26:53
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结果的提示意义看起来还是有些复杂,对了,你的项目中有涉及GWAS的内容吗
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drjiangbo
drjiangbo
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441
楼主
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发表于 2011-1-16 21:15:12
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接下去想做一个exomes的课题,全外显子组
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