阿平的空间 - 新科学想法 - - 在线文献管理与分享平台

阿平

统计信息

已有 131826 人来访过

https://sspai.com/post/71018 回复
https://github.com/ojroques/vim-oscyank 回复
https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035531132--How-to-Call-somatic-mutations-using-GATK4-Mutect2 回复
https://gatk.broadinstitute.org/hc/en-us/articles/360035531132--How-to-Call-somatic-mutations-using-GATK4-Mutect2 回复
http://www.bio-info-trainee.com/7700.html 回复
https://github.com/broadinstitute/gatk/blob/master/scripts/mutect2_wdl/mutect_resources.wdl 回复
https://github.com/broadinstitute/gatk/blob/master/scripts/mutect2_wdl/mutect_resources.wdl 回复
SFRP1 有抑制剂 https://www.nature.com/articles/s41467-022-28626-9 回复
https://kb.10xgenomics.com/hc/en-us/articles/4402869925133-I-have-multiplexed-multiple-samples-in-5-GEX-with-TCR-BCR-libraries-Can-I-use-Cell-Ranger-to-demultiplex-the-samples- 回复
https://kb.10xgenomics.com/hc/en-us/articles/4402869925133-I-have-multiplexed-multiple-samples-in-5-GEX-with-TCR-BCR-libraries-Can-I-use-Cell-Ranger-to-demultiplex-the-samples- 回复
https://www.nature.com/collections/aecebbgajb 回复
https://app.azimuth.hubmapconsortium.org/app/human-kidney 回复
开始国内的日子回复
https://serialmentor.com/dataviz/ 回复
https了回复

现在还没有动态

数据科学的一种Python工作模式：Spyder IDE 远程访问服务器 Jupyter qt console ... . ... 2019-12-30: 做数据科学分析很多时候代码在本地，而数据与运算要依赖在远程的服务器，这点在处理大数据时特别重要。 Jupyter notebook可通过ssh tunnel 的方法使这种远程计算 ...; (1797)次阅读|(0)个评论

yum坏了怎么办？ 2019-12-29: CentOS linux系统中的yum功能坏了，出现以下报错： There was a problem importing one of the Python modules required to run yum. The error leading to ...; (1162)次阅读|(0)个评论

修改BAM的头文件以及相关数据类型 2019-10-04: 以修改染色体命名方式（从chr1换到1）为例 samtools idxstats ./sample.bam | head -n 30 # 查看排列 samtools&nb ...; (1465)次阅读|(0)个评论

R和conda环境问题 SHLIB_LIBADD 2019-07-15: 新建conda虚拟环境有无法使用Nvim-R插件，说nvimcom安装失败提示SHLIB_LIBADD未设置，检查conda环境/envs/rnaseq/lib/R/lib/etc/Makeconf 文件是空的，接着将 ...; (1147)次阅读|(0)个评论

node js与Apache 代理设置 2019-06-25: 没想到会去用node js 和 React，正好更新以下知识：） httpd.conf 中必须启用以下三项： LoadModule proxy_module libexec/apache2/mod_proxy.so LoadModule ...; (1079)次阅读|(0)个评论

常用基因组工具 2019-06-07: short reads genome aligner: BWA, Bowtie, SOAP2 and SOAP3 (支持GPU) 更多对比见文章(陈旧) https://www.nature.com/articles/jhg201143#t3 ...; (1136)次阅读|(0)个评论

阿牛505 2015-12-9 15:28: 非常感谢您！附件今天能下载了！
之前不能下载是：点附件后弹出页面提示“Not found",试了很多次都是这样。
再次感谢您提供这么好的一个平台！

Dr.Moth 2015-7-7 15:24: 阿平: 我查了一下，有6月20日和7月2日的数据，我会仔细再看一下，给我点时间，我帮你先弄好。我知道你手工弄可能需要大量时间 ...
那就請錢兄幫助恢復到20號的數據頁面看看先 :)

Dr.Moth 2015-7-6 16:01: 錢兄可以試試恢復6月27/28日的數據? 恢復后請錢兄點下頁面內的最早的一些超鏈接試試看是否可以打開? 如果還是不行的話還請告訴愚弟, 以免造成兩方面的數據衝突, 還是由愚弟自己來手工恢復了:)

Dr.Moth 2015-7-6 15:28: 阿平 : 方便告诉我你最近一次更新这篇文章在什么时候吗？以便我从备份中帮你恢复。最近一次超鏈接未失效的更新可能是在7月1日乃至之前一兩天因為這文章最近基本隨時都在保持寫入更新在和錢兄反映問題后錢兄有幫我恢復過但是恢復出來的頁面內容太早了所幸有還沒恢復但超鏈接已經失效的網頁還未關閉所以只好自己又複製恢復成這個頁面打算自己一條條手工修改了如果錢兄能幫助當然是更好再次感謝! ... ...

Dr.Moth 2015-7-2 11:09: 錢兄你好近年別來無恙乎? 最近站內似乎又做了調整導致弟發佈的此日誌內所有的超鏈接全部失效東古北區-亞洲-中國天蛾科昆蟲-中国天蛾科昆虫 <US/UK/CN> http://www.xinkexue.com/home.php?mod=space&uid=1387&do=blog&id=4248 不知可否煩請錢兄盡快幫助調整恢復?? 具觀察是在所有的超鏈接末尾被加上了諸如 %5C%22+target=%5C%22_blank%5C%22+target=%5C%22_blank%5C%22+target=%5C%22_blank 或者 %5C%22+target=%5C%22_blank%5C%22+style=%5C%22color:+rgb%280,+0,+0%29;+font-family:+%27%27;+background-color:+rgb ... ...

huke1981 2015-2-4 05:02: 你好，我目前在做CO-IP。第一次用了PIERCE 公司的lysis buffer 的配方（Contents: 25 mM Tris•HCl pH 7.4, 150 mM NaCl, 1% NP-40, 1 mM EDTA, 5% glycerol），lysis细胞5分钟后离心10分钟，有絮状或者胶冻状物质形成，接近管底，但不像一般的沉淀，无法吸取上清液（无论怎么小心，总是要把这团东西洗出来）。于是上网，看到有人说1%NP-40可能导致核蛋白析出，因此第二次我重新配了buffer，将NP-40浓度改为0.5%。这次我 lysis 细胞时间是30分钟，离心15分钟以后仍然行成絮状粘稠胶东样物质，而且无法形成沉淀，悬浮在管子中间。再增加离 ... ...

charles0744 2014-4-28 10:09: 在网上发现您上传的 DeepView(Swiss PDB Viewer)使用简介中文版能否帮我发一份，谢谢！
39058924@qq.com

francisliu 2012-9-14 16:27: 您好！向您请教一个问题：Edgren H, Murumagi A, Kangaspeska S, et al. Identification of fusion genes in breast cancer by paired-end RNA-sequencing. Genome Biol. 2011;12(1):R6 这篇文献后面的R6的页码是多少啊？为什么会有这种页码形式呢？谢谢您！

francisliu 2012-8-11 14:44: 您好！看您发了很多管理文献的方法，请问您觉得您现在的文献管理做得怎么样啊？方便吗？我现在觉得自己的弄得很乱。谢谢啦！

biocq 2012-4-16 12:13: 阿平: 微博上有人对你的“学术合集：长非编码RNA”有评价，特转发
危贵峰:补充一下，2007年 Howard Chang的这篇文章Functional demarcation of active and silent chro ...
thx

reyes 2011-10-13 00:57: hi, 阿平,你好
对于相册列表显示有个建议来着，详见http://www.xinkexue.com/home.php?mod=space&uid=6279&do=album&picid=59159
我是一前端程序员，如果新科学需要什么帮忙的我也很乐意协助。